En 2020, Querétaro está dividido en 18 municipios.

Clave del municipio	Municipio	Población total 2020
001	Amealco de Bonfil	66,841
002	Pinal de Amoles	27,365
003	Arroyo Seco	13,142
004	Cadereyta de Montes	69,075
005	Colón	67,121
006	Corregidora	212,567
007	Ezequiel Montes	45,141
008	Huimilpan	36,808
009	Jalpan de Serra	27,343
010	Landa de Matamoros	18,794
011	El Marqués	231,668
012	Pedro Escobedo	77,404
013	Peñamiller	19,141
014	Querétaro	1,049,777
015	San Joaquín	8,359
016	San Juan del Río	297,804
017	Tequisquiapan	72,201
018	Tolimán	27,916